Inciensa detecta aumento de cepa COVID-19 más contagiosa en Costa Rica

(CRHoy.com) De acuerdo con el último reporte del proceso de vigilancia genómica del SARS-CoV-2, Inciensa identificó un aumento en el linaje A.2.5 y en sus sub-linajes A.2.5.1 y A.2.5.2 desde diciembre pasado a marzo del presente año.

Estos linajes representaron un total de 33% de los genomas analizados y son portadores de la mutación L452R en la espícula viral, la cual se asocia con mayores riesgos en cuanto a transmisión y patologías por COVID-19.

La Organización Mundial de la Salud (OMS) asocia estas cepas con un "aumento en la transmisibilidad, una reducción en la neutralización de algunos anticuerpos monoclonales utilizados como opción de tratamiento y una reducción moderada de la neutralización del virus con sueros de pacientes vacunados", tal y como lo indicó Francisco Duarte, coordinador del Laboratorio de Genómica de Inciensa.

También se observó un aumento en la frecuencia de casos causados por Variantes de Preocupación (VOC) y Variantes de Interés (VOI).

De un total de 325 genomas analizados en este último cuatrimestre, en 54 se detectó alguna de estas variantes. La distribución es la siguiente:

Para variantes de preocupación (VOC) se detectaron:

• 21 genomas asociados a la variante B.1.1.7_501Y.V1_20I, identificada originalmente en Reino Unido.
• 10 genomas asociados a la variante P.1_501Y.V3_20J, descritas en Brasil y Japón.
• 9 genomas asociados a la variante B.1.351_501Y.V2_20H, reportada inicialmente en Sudáfrica.

En conjunto estos 40 casos, representan el 12% de los 325 genomas analizados y provienen de todas las provincias del país.

Así mismo, para las variantes de interés (VOI) se detectaron:

• 7 genomas pertenecientes a la variante B.1.427_452R_CAL.20C, descrita originalmente en California.
• 4 casos de la variante B.1.525_4845K.V3_20A/S, inicialmente reportada en Reino Unido y Nigeria.
• 2 casos de la variante B.1.526_484K_20C, identificada a finales del 2020 en Nueva York.
• 1 caso de la variante P.2_484K_20B/S, descrita inicialmente en Río de Janeiro.

Por otra parte, en este análisis también se detectó la disminución en la frecuencia del linaje B.1.1.389, durante las primeras semanas epidemiológicas del 2021.

Este linaje se caracteriza por presentar la mutación T1117I en la espícula viral y fue predominante en Costa Rica durante el año 2020.

"Durante ese año, el país registró 91 % de los genomas de dicho linaje, del total identificados a nivel mundial", señaló el Dr. Duarte.

A la fecha, Inciensa ha secuenciado y analizado un total de 523 genomas del SARS-CoV-2 , labor que lleva a cabo en conjunto con el Laboratorio de Microbiología del Hospital Nacional de Niños (HNN), la Universidad de Costa Rica (UCR) y la Universidad Nacional (UNA).